Кстати по вопросу
1. Настройки Selinux после ребута падают в дефолт.
Оказывается теперь если использовать setsebool без опции -P то после ребута настройки слетают. Раньше этого не было, покрайне мере в 5-м Центе все проде работало без -P.
Буду рыть дальше косяки.

Я не совсем понимаю чем через груб не нормальный способ. Если SELinux выключен он выключен и ни как иначе.

Я понимаю, что можно выключить и через груб, однако предпочитаю ориентироваться на официальную документацию того же Red Hat, в которой, однако, про груб ничего не говорится: http://goo.gl/ZdR3A

Кстати, ScientificLinux6 это ещё Бета?
Может стоит у них спросить об этом, или сообщить об этом баге?

С 18 февряля вроде как релиз кандидат уже.
Самое смешное я у них на сайте даже форума не нашел (((

Отключите SELinux нормальным способом, а не через груб.
Логи по поводу мускула где? Необходимо угадать, что пишется или как?

Я не совсем понимаю чем через груб не нормальный способ. Если SELinux выключен он выключен и ни как иначе.
Логи mysql ничего не показывают потому и не постил их сюда.

Вообщето четырьмя  wink
Помимо перечисленных ещё можно временно отключить:

 Консоль:

# cat /selinux/enforce
1
# echo 0 > /selinux/enforce
# cat /selinux/enforce
0

И отключить для какого либо сервиса:

 Консоль:

# cat /etc/selinux/targeted/booleans | grep mysqld
mysqld_builtin_scripting=1
mysqld_disable_trans=1
mysqld_enable_cgi=1
mysqld_enable_homedirs=1
mysqld_ssi_exec=1
mysqld_tty_comm=0
mysqld_unified=1

Это конечно все интересно, но тема немного о другом  smile

Не знаю что там с ScientificLinux, я не пробовал с ним плясать, (да и зачем, если есть CentOS?), но RHEL вовсе не сырой. Он вылизан "ОТ" и "ДО".
А SELinux отключается так:

 Консоль:

# cat /etc/selinux/config
SELINUX=disabled
SELINUXTYPE=targeted
SETLOCALDEFS=0

Вобще Selinux отключается 2-мя способами или так или в grub.conf передать ядру selinux=0
CentOS6 еще не вышел и сроки не известны.

1. Настройки Selinux после ребута падают в дефолт.
2. Если выключить и включить Selinux (Я выключал через grub.conf selinux=0) Selinux мало того что падает в дефолт, но после этого даже прописка деректив в rc.local не меняет ситуации.
3. Mysql пускает из консоли только root, а из под php скриптов даже root не конектится (Пробывал с Selinux и без). Единственное чего удалось добится это после обновления Mysql из репозитория remi из консоли начало пускать и других пользователей, но из php скриптов все также глухо.

Мне вот интересно ScientificLinux позиционируется так же как и CentOS полная совместимость с RHEL, хотелось бы узнать RHEL в релизе тоже такой сырой?