ничего страшного, если я обойду ярлык и буду копировать в папку private?

Ничего страшного, только убедитесь, что символическая ссылка с именем /var сохраняется и указывает на каталог /private/var.

Точнее, возможно, потому что там установлены «своеобразные» версии программ?

не знаю...
проблема скорее всего в невозможности копирования по ярлыку "var"
ничего страшного, если я обойду ярлык и буду копировать в папку private?

cp -af /PACK/PREF/* "/"

var поместил в private

и вроде бы, получается то. что и хотел... )

Кстати, вы не проверяли, сами нужные вам файлы копируются, несмотря на сообщение об ошибке?

нет, не копируются (

может , потому что iphone? )

Точнее, возможно, потому что там установлены «своеобразные» версии программ?
...но проверить не могу.

может быть в этом проблема?

Я уже видел, у себя проверял, у меня нормально переписывает символические ссылки.

cp: missing destination file operand after `/PACK/PREF/var'

Пропустили последний слеш

Опять пропустили слеш и пробел перед /PACK/PREF/*

Покажите

ls -l /var

localhost:~ root# ls -l /var
lrw-r--r-- 1 root admin 12 Sep 27 21:15 /var -> private/var//
localhost:~ root# 

localhost:~ root# cp -af /PACK/PREF/* 
cp: missing destination file operand after `/PACK/PREF/var'
Try `cp --help' for more information.
localhost:~ root# 

localhost:~ root# cp -a  --remove-destination/PACK/PREF/* 
cp: unrecognized option '--remove-destination/PACK/PREF/*'
Try `cp --help' for more information.
localhost:~ root# 

cp -af /PACK/PREF/* /

если не получится, то так

cp -a  --remove-destination /PACK/PREF/* /