yum list installed | grep -v @anaconda

по идее, так... покажет все пакеты установленные НЕ анакондой

Да, так показывает. Правда уж сильно много пакетов, но в некоторых есть ссылки на репи:

ttf2pt1.x86_64          3.4.4-9.el6     @epel
ttmkfdir.x86_64         3.0.9-32.1.el6  @base
vim-common.x86_64       2:7.2.411-1.8.el6
vim-enhanced.x86_64     2:7.2.411-1.8.el6
vim-minimal.x86_64      2:7.2.411-1.8.el6

Благодарю за помощь.

yum list installed | grep -v @anaconda

по идее, так... покажет все пакеты установленные НЕ анакондой

Не поможет фильтр по названию репы? Тогда я вообще не могу понять, что Вы хотите получить.
Чтобы пакеты оставались в системе, необходимо в /etc/yum.conf выставить keepcache=1. По умолчанию, выключено.
И зачем Вам эти пакеты?

За подсказку keepcache=1 респект !. А получить я хочу информацию какие пакеты были доставлены в системе с репозитариев.

1.

# yum list installed | grep epel-skype
skype.i686              4.2.0.11-8.el6  @epel-skype                             
skype-data.noarch       4.2.0.11-8.el6  @epel-skype     

2.

/var/cache/yum

Так я много чего ставил, фильтр мне не поможет.
А сами rpm-ки сохраняються на компе ?

/var/cache/yum

Так там находится перечень самих репозитариев,
а что с них скачано и установлено - где смотреть ?

# yum list installed | grep epel-skype
skype.i686              4.2.0.11-8.el6  @epel-skype                             
skype-data.noarch       4.2.0.11-8.el6  @epel-skype     

2.

/var/cache/yum