Покажите вывод

 Консоль:

amixer -c 0 

Если в выводе есть что -либо подобное
Simple mixer control 'Front Mic',0
  Capabilities: pvolume pswitch
  Playback channels: Front Left - Front Right
[просто выключите в alsamixer

Благодарю, разобрался. Я его и включал/выключал, думал без него работать не будет   А без него микрофон работает!
Для работы надо было только микшер 'Capture',0 был привязан к микрофону!

Это не эхо так как просто сильный звук, выведенный в наушники, не дублируется.
В пирнципе помогает установка почти на минимум уровня записи с микрофона, при этом вполне комфортно общаться, через скайп.
Но всё равно, пока микшер микрофона включен в наушники/колонки идёт слабое шипение.
На данный момент борюсь включением/выключением микшера микрофона перед и после непосредственного использования.

uname -a
Linux pclin 3.10.17-gentoo #1 SMP Wed Nov 6 20:15:08 FET 2013 x86_64 AMD Athlon(tm) II X2 240 Processor AuthenticAMD GNU/Linux

cat /proc/asound/cards
 0 [SB             ]: HDA-Intel - HDA ATI SB
                      HDA ATI SB at 0xfe8f4000 irq 16
 1 [HDMI           ]: HDA-Intel - HDA ATI HDMI
                      HDA ATI HDMI at 0xfe9ec000 irq 45

lspci -v | grep -i audio
00:14.2 Audio device: Advanced Micro Devices, Inc. [AMD/ATI] SBx00 Azalia (Intel HDA)
01:00.1 Audio device: Advanced Micro Devices, Inc. [AMD/ATI] RV710/730 HDMI Audio [Radeon HD 4000 series]

Alsa в ядре:

cat /proc/asound/version
Advanced Linux Sound Architecture Driver Version k3.10.17-gentoo.