Кстати, проверьте может у вас приватный RSA-ключ. В заголовке приватного RSA-ключа примерно указано следующее:

 Консоль:

-----BEGIN RSA PRIVATE KEY-----

То его надо предварительно расшифровать:

 Консоль:

openssl rsa -in /path/to/key/directory/ssl_rsa.key -out /path/to/key/directory/ssl.key

Где /path/to/key/directory/ - путь до каталога с RSA-ключом и путь до каталога в который будет сохранен расшифрованный ключ.

расшифровку я сделал ранее

Сертификат не самоподписанный.
Сертификат выдан Comodo PositiveSSL

Скорее всего у вас сертификаты местами надо поменять. Даже по виду это ясно. В строке cert должен быть указан файл *.crt или *.pem, а строке key, приватный ключ *.key.

 TLS error on connection from mail-lb0-f179.google.com [209.85.217.179] (cert/key setup: cert=/etc/exim4/ssl/server.key key=/etc/exim4/ssl/server.crt): Base64 unexpected header error.

Сертификат не самоподписанный.
Сертификат выдан Comodo PositiveSSL