Можно не делать ничего.
Осиротевшие пакеты -- это старые зависимости, которые уже не используются. Но эти же пакеты могут пригодится в будущем, к примеру при установке какой-нибудь программы или компилировании.
Я например их не удаляю, если хочешь, можешь удалить:
Консоль:
# urpmi --auto-orphans --force
]]>