У меня простой вопрос -  а как засунуть делюг в автозагрузку, чтобы при запуске компа он сразу запускался?

зависит от нескольких факторов...
если вы используете его как сервер/морда, то правите конфиг(внимание на DELUGED_USER) и добавляете демон в автозагрузку... где/как зависит от дистра... у меня конфиг /etc/conf.d/deluged
если используете его как простой клиент, то средствами DE.
для kde или делаете ссылку на deluge или пишите скрипт для запуска в ~/.kde/Autostart/
для остальных - точно не помню, но копать в сторону ~/.config/autostart/

И судя по всему firewall пропускает

Проверка порта показывает «Port is open»?

Сам пользуюсь Deluge, нареканий особых никогда не было. Главное - правильно firewall настроить
А как Вы определяете, что он перестаёт держать связь? Может элементарно никто не качает

Не тянет и не раздает. Так он через раз качает :o

робросы прописал.

Следует ли понимать, что порт для входящих соединений вы открыли и убедились в этом?
Понимаю, не аргумент, но я работой Transmission вполне доволен (был не совсем удачный опыт работы с Deluge). Тут сколько людей — столько мнений.