Задача стоит именно в настройке SFTP. FTP через SSL у меня и так настроено. В США есть какие-то законы или указание для государственных предприятий, что работать можно только по SFTP. И поэтому такие американские клиенты отказываются пользоваться нашими FTP серверами. С вытекающими последствиями. Насколько я понял настроить SSH/SFTP через виртуальных пользователей - это извращение. Но хотелось бы какие то факты услышать. Т.к. мне придется общаться с начальством по этому поводу. Насколько я понимаю FTPS по безопасности не хуже SFTP.

Создавать же системных пользователей для этих клиентов - тоже не хочется...

А, вообще, спасибо за ответ. Я уже просто реально все облазил в поисках решения.

Спасибо тебе i2ks. Я эту ссылку тоже единственную нашел по теме. Т.к. в инетах люди часто путают FTPS и SFTP, то поиск еще более затрудняется.
Вобщем спасибо за помощь. Теперь я еще больше уверен, что реализация схемы которую от меня требуют - утопия, не соответствующая механизму работы самого ssh. Т.к. требуют интеграция именно с файликом .htpasswd.
Буду пытаться объяснить это начальству. Буду делать либо через системных пользователей, либо через mysql. Но тему я не хочу закрывать... может кто-нибудь кто сталкивался с такой ситуацией увидит ее и еще больше убедит меня в правоте.