Кажется, так исторически сложилось, что ПО создает свои каталоги в домашнем каталоге вида ".$APPNAME$".
И менять это с точки зрения ПО уже затруднительно(террабайты ПО).
Но мешура эта километровая надоела уже. Я думаю, что это не совсем правильно и удобно(как пользователю).
Почему-бы не найти им общее место где-нибудь поудобнее(.apps, .appdata)?
".config" организован же?
Или действительно разрботчики ("архитекторы UNIX") сочли более удобным именно такой вариант? Или потому, что у Винды так?
На самые толковые из прогнозируемых ответов отвечу сразу:
с CTRL+ALT+H не согласен(могу обосновать).