system-root, когда у тебя есть права админа, ты что угодно можешь поставить, какую угодно библиотеку, какой угодно модуль ведра.
Но когда нет - не можешь.
Уязвимости под линукс довольно быстро затираются, под Windows же на них кладут... пока пара месяцев не пройдёт, не исправят. А самому залатать ещё и незаконно.
А многим (геймерам, например) просто пофик на эти уязвимости. Вот и ставят себе антивирусы, а потом жалуются, что кризис под 10-ядерным процом тормозит. 
komcumir пишет:Даже если некая зараза, не обладает правами рута, а только юзера, то тоже мало хорошего если вдруг обнаружишь девственно чистого хомяка...
Это, конечно, можно сделать. Но практической пользы злоумышленнику от этого мало. Хотя, конечно, бывают и такие цели - стереть и затереть какую-то важную стратегически инфу. 
Но чаще необходимо, к примеру, вызвать отказ в обслуживании (червя подкинуть), или шпионить за пользователями. Первое делают черви... но их работа затруднительно с правами юзверя на линуксе, так как любой раздел на ext2/3/4 имеет (по умолчанию) лимит записи для пользователя, умные администраторы ещё и квоту добавляют. Ну и выносят отдельно корень, отдельно хомяк, отдельно вар, и т.п...
Второе делают трояны, ну может, руткиты.
Ну, с руткитами понятно - тут нужна модификация исполняемых файлов. Если вы ставите ПО с какой-то левого сайта, то тут никакой защиты нет. Если из реп - защищены на 99%. а уж если из исходников компилите, предварительно их прочитав доскольнально
ну такое редко бывает, да.
Троян не подкинешь опять же без прав... они же должны куда-то инфу отправлять незаметно, и т.п... в общем, сомневаюсь я в этом. В идеале они должны модифицировать вывод таких утилит как iptables, netstat, и т.п... иначе их легко заметить.