К сожалению я не знаю что такое xp_gnome. Как я понял делает из нормальной линухи ужас тип винды=))
Конечно это дело привычки).
Не знаю как это отключается или включается.
Варианты:
1) я бы предложил попробывать предположим создать нового пользователя с стндартным интерфейсом скопировать War3 а ~/.wine/drive_c/Program Files в ново созданого и попробывать запустить....
2)выключить сие чудо у текущего пользователя(что возможно проще) и запустить.
3) просто в настройках панели тыкнуть скрывать автоматически?)
4) котрываем терминал пишем:
>X :8&
>export DISPLAY=:8
>xterm
нажимаем ctrl+alr+f8 попадаем на новосозданые X.
в них в xterm
>cd ~/.wine/drive_c/Program Files/Wacrft3 (или как он там у вас называется)
>wine War3.exe -opengl
и в winecfg НЕ ставьте глачку эмулировать рабочий стол)
100% должно работать но мб не совсем верное решение, но в кс я играю именно так)