1. ldd $(which gimp)
2.tail +13 CHECKSUMS.md5 | md5sum -c --quiet - | less

Второе (см. заголовок темы) описано в файле CHECKSUMS.md5 и к зависимостям не имеет никакого отношения.
UPD: для проверки зависимостей всей системы можно поступить примерно так:

for file in $(find / -type f -executable 2>/dev/null); do ldd $file | grep "not found" | sort -u >> ~/dependencies.txt

Не работает это ни каким каком! Что это за заклинания?

Это здравая идея в плохой реализации.
Идея: пройтись по всем исполняемым файлам, для каждого позвать "ldd имя_файла", поискать в выводе "not found" и сложить результат -- отсутствующие библиотеки, нужные кому-либо -- в файл ~/dependencies.txt, исключив дубликаты.
Дефекты реализации:
1) аргумент for легко может вылезти вылезет за предельный размер командной строки, решение -- замена "for f in $(команда);" на "команда | while read f;"
2) среди исполняемых файлов довольно много скриптов на чём угодно, с другой стороны, ldd на это "по барабану";
3) с практической точки зрения может оказаться достаточным анализа /usr/local/bin;/usr/bin;/bin;/usr/local/sbin;/usr/sbin;/sbin;/usr/lib;/usr/libexec плюс содержимое PATH

По поводу поиска зависимостей есть slackdeptrack и ещё несколько подобных.