Я не думаю, что ФСБ заинтересуется версией для домашних пользователей - во FRESH, где большинство ПО с открытыми исходниками, и любой кто хочет, из любого сообщества может посмотреть все возможные для исследования исходники - в ПО с открытыми исходниками закладок не может быть в принципе - так как "спец закладки" сразу будут раскрыты пользователями.
Если брать часть пакетов с закрытыми исходниками (не с GPL лицензиями)  - они одинаковы для всех дистрибутивов, а значит закладки будут, не только, в ROSA, но и во всех дистрибутивах, где используется данное ПО.
Про спец версии (сертифицированные, где возможно спец ПО, не доступное обычному пользователю) - не знаю - там, в зависимости от заказчика, ФСБ может и вмешаться,  хотя скорее могут "посоветовать" и другие спец дистрибутивы, тот же ГосЛинукс...