да все нормально там ag уши на отсечение, что вы что-то там намудрили с добавлением раскладок (ну... и видимо, все, кто испытывают "эти косяки" так-же перемудрыствуют с настройками/раскладками)
Похоже тут завязка с иксами, ваши настройки не работают, у меня если для русской локали установить флажок на Latin, то печатает латинскими а не русскими, тут какая то завязка с xkb, по этому пока поменял раскладку по умолчанию, без латинских букв.

Теперь все работает без костылей, но все таки хотелось бы выпилить переопределение системной раскладки kxkb.
В принципе у меня отсутствует /etc/X11/xkb, с которым работает kxkb, как вариант можно его скопировать из /usr/share/X11/xkb и посмотреть будет разница или нет 
*** Добавлено: 22.11.2018 10:42:20 ***
Все разобрался где собака зарыта.
Все дело было в запущенном fcitx, оно как раз и создавало проблемы с переключением с русской локали. 

