Да, можно. Вы хотите переустановить Windows и потом снова перенести разделы с Ubuntu?
Не совсем. Я решил, чтобы в дальнейшем избежать подобных проблем выделить пока Windows свой HDD, а Ubuntu свой. Собственно я уже это сделал. Однако... Меня смущает один момент - я толи я что-то не то делаю, толи еще какой-то не известный мне момент (скорее всего), в общем я сейчас работаю с перенесенной на новый HDD Ubuntu, просто как я не старался в процессе переноса в GParted работала утилита e2image, а по идее то должна была работать e2clone и вот в силу не полного осмысления я не знаю, что мне предпринять дальше? Просто я фактически копировал разделы Ubuntu на новый диск, а не клонировал весь HDD полностью. Или все нормально и не надо зацикливаться? Спасибо.
Сначала восстанавливаете загрузку Windows, затем устанавливаете grub. И будут грузиться и Windows и Linux.
Собственно я так и поступил, но никак не думал, что будет столько проблем. Спасибо.