Установка зависимостей

Если у вас в /etc/apt/sources.lst прописаны репозитории исходных кодов (deb-src), для установки всех необходимых для сборки Wine библиотек можно выполнить:

apt-get update
apt-get build-dep wine

Если же репозитории исходных кодов вы не используете, установить библиотеки поможет примерно такая команда:

sudo apt-get install \
  gcc-4.4 gcc-4.4-multilib make flex bison \
  libx11-dev libxinerama-dev libxcomposite-dev libxrandr-dev libxrender-dev libxxf86vm-dev libxi-dev libxcursor-dev \
  libgl1-mesa-dev libglu1-mesa-dev \
  fontforge fontconfig libfontconfig-dev \
  libxml2-dev libxslt-dev \
  libgphoto2-dev libpng-dev libjpeg62-dev \
  libsane-dev libcupsys2-dev \
  libldap-dev libcapi20-dev libssl-dev liblcms-dev lib32z1-dev
  

Попробуйте выполнить скрипт ./configure в каталоге с исходниками. В конце выполнения, скрипт может вывести перечень отсутствующих библиотек1) - доустановите их, если соответствующие возможности Wine вам нужны.
Сборка

./configure && make depend && make

Подробности см. в файле INSTALL.
Создание и установка .deb-пакета (Debian)

Перед началом, необходимо удалить все пакеты wine* и libwine*, а также установить пакет checkinstall.

Кроме того, необходимо вручную удостовериться, что все зависимости Wine установлены, поскольку созданный с помощью checkinstall пакет не будет содержать информации о зависимостях. Как правило, если такой пакет «ручной сборки» ставится в систему после удаления любого другого .deb-пакета Wine (к примеру - из его репозиториев, либо из официальных репозиториев Debian), проблем с зависимостями не будет.

sudo checkinstall -D -y --fstrans=no --install=yes --pkgname=wine \
  --pkgversion=`colrm 1 13 < VERSION``test -e .git && echo +git` --pkgrelease=at`date +%Y%m%d%H%M%S`

Подробности см. в man checkinstall.